Keberadaan MTs. Negeri 6 Sumedang sebagai bagian integral dalam upaya mencerdaskan kehidupan bangsa, tidak hadir begitu saja, melainkan melalui suatu proses perjalanan yang relatif cukup panjang. Bermula dari berdirinya Pendidikan Guru Agama (PGA) Muhamadiyah pada tahun 1969 / 1970 atas prakarsa para tokoh pendidik, tokoh agama dan masyarakat.
Dari sekolah Pendidikan Guru Agama (PGA) Muhamadiyah kemudian menjadi MTs GUPPI Cimasuk dibawah naungan Yayasan GUPPI dan mendapat Piagam Terdaftar dari Departemen Agama Provinsi Jawa Barat tanggal 21 Februari 1981.
Tahun 2009 tepatnya 6 Maret 2009, MTs GUPPI Cimasuk berubah status menjadi Negeri dengan nama MTs Negeri Pamulihan melalui Keputusan Menteri Agama Nomor 48 Tahun 2009 tentang Penetapan 70 (Tujuh puluh) Mts. Negeri, Selanjutnya terhitung sejak tanggal 27 Juli 2015, berdasarkan Keputusan Menteri Agama Nomor 212 Tahun 2015, Madrasah Tsanawiyah Negeri (MTsN) Pamulihan Kab. Sumedang berubah namanya menjadi MTs Negeri 6 Sumedang.